IBM, Mayo Form Open-source Health IT Consortium

Forskere ved biomedisinsk informatikk ved IBM og Mayo Clinic har lansert et nytt open source-konsortium med fokus på naturlig språkbehandling (NLP), i et forsøk på å hjelpe leger med å dele diagnose- og behandlingsinformasjon.

Open Health Natural Language Processing Consortium, annonsert torsdag, vil fokusere på teknologi for å muliggjøre storskala dataaggregering, slik at leger kan ta medisinske journaler i sine spesialiteter for å finne lignende saker å studere før de gjør vanskelige diagnoser eller før de bestemmer behandling. Legene vil kunne gjennomgå noen lege notater om lignende tilfeller, men ingen personlig identifiserbar pasientinformasjon vil være tilgjengelig i databasen, sa IBM og Mayo.

Med lanseringen av konsortiet har de to organisasjonene gitt ut to prosjekter under åpen sourc e lisenser, en fokusert på kliniske notater og en på patologiske rapporter. Konsortiet bruker Apache-lisensen, versjon 2.0.

Organisasjonene inviterer andre til å utvikle NLP-verktøy. "Ved å gjøre det til en åpen kildekode-initiativ, håper vi å muliggjøre bred bruk av disse NLP-verktøyene, slik at medisinske fremskritt kan skje raskere og mer effektivt, sier Dr. Christopher Chute, en bioinformatikkekspert fra Mayo Clinic og senior konsulent på prosjektet. en uttalelse.

To andre helsevesenetorganisasjoner, Seattle Group Health og US Department of Veterans Affairs Boston Healthcare System, planlegger å delta i konsortiet, og andre deltakere er velkomne, sa IBM og Mayo.

Som mer helse omsorgsleverandører vedtar elektroniske helsjournaler, blir det stadig viktigere å kunne søke på disse postene, sa organisasjonene. Mayo og IBM har utviklet et system for utvinning av informasjon fra mer enn 25 millioner tekstbaserte kliniske notater basert på IBMs åpen kildekode Ustrukturert Informasjonsstyringsarkitektur, eller UIMA. De to organisasjonene har også utviklet et system for å trekke ut kreft sykdommer egenskaper fra patologi rapporter, som tillater beregning av kreft scenen.

"Storskala informasjon utvinning fra den kliniske fortellingen er en viktig komponent i å fremme translationell forskning og pasientomsorg," Guergana Savova, en medisinsk informatikk spesialist og Mayo lede på prosjektet, sa i en uttalelse. "Det låser opp" de kliniske tekstdataene som ligger i store arkiver. Slik teknologi vil muliggjøre omfattende dataaggregering, analyser og bruk - bare tenk på dataene fra millioner av pasienter. "

Organisasjonene har ikke ennå fastslått hva NLP prosjekter for å jobbe på neste, sa en IBM-talskvinne. "Målet er først å få tilbakemelding fra deltakende institusjoner på det opprinnelige prosjektet, og deretter utvide," sa hun.